Cách đăng ký thuế lần đầu trực tiếp với CQT từ Thông tư 90

Quy định về đăng ký thuế lần đầu trực tiếp với CQT theo Thông tư 90 từ 1/7/2026. Hồ sơ đăng ký thuế, cách đăng ký thuế trực tiếp. Mẫu tờ khai đăng ký thuế.

I. 15 đối tượng phải đăng ký thuế trực tiếp với cơ quan thuế theo Thông tư 90

Theo Thông tư 90/2026/TT-BTC, từ ngày 01/07/2026 thì 15 đối tượng sau đây phải tiến hành đăng ký thuế trực tiếp với cơ quan thuế: 

1. Doanh nghiệp kinh doanh các lĩnh vực chuyên ngành không phải đăng ký kinh doanh theo quy định của pháp luật chuyên ngành (tổ chức kinh tế).

2. Tổ chức kinh tế của lực lượng vũ trang, các tổ chức chính trị - xã hội hoạt động kinh doanh theo quy định của pháp luật nhưng không phải đăng ký kinh doanh; tổ chức có chung đường biên giới đất liền với Việt Nam hoạt động mua bán trao đổi hàng hóa tại chợ cửa khẩu, biên giới, khu kinh tế tại cửa khẩu; văn phòng đại diện, chi nhánh của tổ chức nước ngoài tại Việt Nam.

3. Tổ chức được thành lập bởi cơ quan nhà nước, tuy không hoạt động sản xuất kinh doanh nhưng có phát sinh nghĩa vụ nộp thuế nhà nước.

4. Người nộp thuế được hoàn thuế GTGT, bao gồm các trường hợp sau:

• Tổ chức ở Việt Nam dùng tiền từ viện trợ nhân đạo, viện trợ không hoàn lại của tổ chức, cá nhân nước ngoài để mua hàng hóa, dịch vụ phục vụ cho dự án viện trợ nhân đạo, viện trợ không hoàn lại;
• Tổ chức, cá nhân được hưởng quyền ưu đãi miễn trừ ngoại giao theo quy định về ngoại giao mua bán hàng hóa, dịch vụ tại Việt Nam.

5. Tổ chức nước ngoài có hoạt động kinh doanh trên nền tảng thương mại điện tử (TMĐT) tại Việt Nam. Tuy nhiên, các tổ chức nước ngoài này không phải thực hiện đăng ký thuế trong trường hợp toàn bộ doanh thu phát sinh tại Việt Nam đã được doanh nghiệp đối tác khấu trừ và nộp thay thuế.

6. Cá nhân không cư trú có kinh doanh nền tảng thương mại điện tử nhưng không có chức năng đặt hàng trực tuyến và chức năng thanh toán theo quy định.

7. Tổ chức, doanh nghiệp nước ngoài không có tư cách pháp nhân tại Việt Nam (trừ tổ chức kinh doanh sàn TMĐT tại Việt Nam), cá nhân nước ngoài hoạt động kinh doanh độc lập tại Việt Nam (trừ cá nhân kinh doanh sàn TMĐT không đủ điều kiện) có thu nhập tại Việt Nam hoặc có phát sinh nghĩa vụ thuế.

8. Doanh nghiệp có trách nhiệm khấu trừ và nộp thay thuế đã khấu trừ của người nộp thuế khác, bao gồm:

• Doanh nghiệp, cá nhân khấu trừ và nộp thay thuế cho nhà thầu nước ngoài, nhà thầu phụ nước ngoài;
• Doanh nghiệp tại Việt Nam tính thuế GTGT theo phương pháp khấu trừ thực hiện khấu trừ và nộp thuế thay cho nhà cung cấp nước ngoài;
• Chủ quản sàn thương mại điện tử, nền tảng số khác trong nước có chức năng đặt hàng trực tuyến và chức năng thanh toán có khấu trừ và nộp thay thế cho nhà cung cấp nước ngoài, hộ kinh doanh (HKD), cá nhân kinh doanh (bao gồm cá nhân không cư trú và cá nhân cư trú);
• Doanh nghiệp khấu trừ và nộp thay thuế cho cá nhân có hợp đồng hoặc văn bản hợp tác kinh doanh. Trường hợp này, tổ chức chi trả thu nhập khi khấu trừ và nộp thay thuế TNCN sử dụng mã số thuế đã được cấp để kê khai và nộp thuế thay.

9. Người điều hành, công ty, văn phòng, tổ chức được phân công, ủy quyền điều hành dự án dầu khí; doanh nghiệp liên doanh; tổ chức được Chính phủ Việt Nam giao nhiệm vụ tiếp nhận phần được chia của Việt Nam thuộc các mỏ dầu khí tại vùng chồng lấn; nhà thầu tham gia dự án hợp đồng dầu khí; công ty mẹ - Tập đoàn Công nghiệp - Năng lượng Quốc gia Việt Nam được chia lãi từ các hợp đồng dầu khí.

10. Hộ gia đình, cá nhân kinh doanh hàng hóa, dịch vụ thuộc đối tượng không phải đăng ký HKD; cá nhân kinh doanh có chung đường biên giới đất liền với Việt Nam thực hiện hoạt động mua bán, trao đổi hàng hóa, dịch vụ tại chợ biên giới, chợ cửa khẩu, chợ trong khu kinh tế cửa khẩu.

11. Cá nhân có thu nhập thuộc diện chịu thuế TNCN (trừ cá nhân kinh doanh).

12. Cá nhân là người phụ thuộc theo quy định về thuế TNCN.

13. Tổ chức, cá nhân được cơ quan thuế ủy nhiệm thu.

14. Tổ chức kê khai và nộp thuế TNDN bổ sung theo quy định về thuế tối thiểu toàn cầu.

15. Tổ chức, hộ gia đình và các cá nhân có nghĩa vụ với ngân sách nhà nước.

II. Địa điểm nộp hồ sơ đăng ký thuế lần đầu từ ngày 01/07/2026

Hiện tại, nơi nộp hồ sơ đăng ký thuế lần đầu của người nộp thuế được quy định như sau:

• Nộp tại Thuế cơ sở nơi đặt trụ sở chính: Nếu có trụ sở;
• Nộp tại Thuế cơ sở nơi có địa chỉ cư trú của cá nhân kinh doanh: Nếu người nộp thuế là cá nhân kinh doanh không có địa điểm kinh doanh cố định; 
• Đối với người nộp thuế là cá nhân có bất động sản cho thuê (bất động sản cho thuê ở cùng địa điểm hoặc ở các địa điểm khác nhau): Có thể lựa chọn nộp hồ sơ đăng ký thuế tại một trong các Thuế cơ sở tại nơi có bất động sản cho thuê.

III. Hình thức đăng ký thuế lần đầu

Thông tư 90/2026/TT-BTC quy định 2 hình thức đăng ký thuế lần đầu cho người nộp thuế, bao gồm:

1. Đăng ký theo cơ chế một cửa liên thông: Doanh nghiệp, hợp tác xã, đơn vị phụ thuộc và HKD thuộc diện đăng ký kinh doanh theo cơ chế một cửa liên thông. Thông tin đăng ký thuế sẽ được tích hợp và chuyển sang cơ quan thuế;
2. Đăng ký trực tiếp với cơ quan thuế: Tổ chức, hộ gia đình, cá nhân không đăng ký thông qua cơ quan đăng ký kinh doanh; nhà thầu, nhà cung cấp nước ngoài và các đối tượng quy định tại Điều 4 Thông tư 90/2026/TT-BTC sẽ đăng ký thuế trực tiếp với cơ quan thuế.

IV. Hướng dẫn cách đăng ký thuế trực tiếp với cơ quan thuế

1. Cách nộp hồ sơ đăng ký thuế

Hiện tại, người nộp thuế có thể nộp hồ sơ theo các cách sau:

• Nộp hồ sơ trực tiếp;
• Gửi hồ sơ qua bưu điện;
• Nộp hồ sơ bằng phương thức điện tử (*).

Trong vòng 1 ngày làm việc, tính từ khi hệ thống ghi nhận hồ sơ mà người nộp thuế đã nộp, cơ quan thuế sẽ gửi thông báo tiếp nhận hoặc không tiếp nhận. Đối với trường hợp không tiếp nhận, cơ quan thuế phải nêu rõ lý do để người nộp thuế hoàn thiện hồ sơ.

Chú thích:

(*) Theo Điều 6 Thông tư 90/2026/TT-BTC, hồ sơ điện tử có thể nộp qua 1 trong 3 nền tảng sau:

• Cổng dịch vụ công quốc gia;
• Ứng dụng định danh quốc gia (VNeID);
• Hệ thống thông tin quản lý thuế (eTax mobile).

2. Hồ sơ đăng ký thuế lần đầu theo hình thức đăng ký trực tiếp tại cơ quan thuế

2.1. Đối với hộ gia đình và cá nhân kinh doanh đăng ký thuế trực tiếp

Lưu ý:

(**) Cá nhân chỉ được ủy quyền đăng ký tại một cơ quan chi trả.

2.2. Đối với tổ chức đăng ký trực tiếp với cơ quan thuế

Trường hợp tổ chức đăng ký thuế trực tiếp với cơ quan thuế, nơi nộp hồ sơ được xác định theo trụ sở, địa điểm hoạt động của người nộp thuế.

Có thể bạn quan tâm:

>> Các biểu đăng ký thuế theo Thông tư 90;

>> 21 biểu mẫu đăng ký thuế cho cá nhân, hộ kinh doanh;

>> Tổng hợp mẫu tờ khai đăng ký thuế - từ ngày 01/07/2026;

>> Cách đăng ký thuế online cho hộ gia đình, cá nhân kinh doanh;

>> Cách đăng ký thuế lần đầu cho cá nhân và người phụ thuộc.

IV. Câu hỏi thường gặp khi đăng ký thuế lần đầu

1. Khi nộp hồ sơ trực tiếp, làm sao để biết hồ sơ của người nộp thuế đã hợp lệ hay chưa?

Cán bộ thuế tại Thuế cơ sở sẽ tiến hành kiểm tra thành phần hồ sơ của người nộp thuế ngay tại quầy. Nếu hồ sơ đầy đủ, cán bộ thuế sẽ đóng dấu và cấp phiếu tiếp nhận hồ sơ hoặc phiếu hẹn trả kết quả cho người nộp thuế.

2. Có bắt buộc phải nộp hồ sơ đăng ký thuế trực tiếp hay không?

Hiện tại, cơ quan thuế khuyến khích người nộp thuế nộp hồ sơ bằng phương thức điện tử. Đối với một số trường hợp đặc thù chưa thể giao dịch điện tử, doanh nghiệp hoặc cá nhân có thể nộp hồ sơ trực tiếp tại cơ quan thuế. 

Lưu ý:

Trước khi nộp hồ sơ trực tiếp, người nộp thuế nên liên hệ với cơ quan thuế chủ quản để xác nhận cơ quan thuế đó có nhận hồ sơ bản giấy hay không.

3. Thời hạn phản hồi hồ sơ đăng ký thuế nộp trực tiếp tại cơ quan thuế là bao lâu?

Trong thời hạn 3 ngày làm việc, cơ quan thuế phải gửi thông báo chấp nhận hoặc thông báo không chấp nhận hồ sơ đến người nộp thuế (có kèm theo lý do cụ thể nếu hồ sơ chưa hợp lệ).

Lưu ý:

Thời hạn trên không bao gồm thời gian người nộp thuế thực hiện việc giải trình và bổ sung tài liệu theo yêu cầu.

Phương Uyên - Phòng Kế toán Anpha